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教育部水处理与水环境修复工程研究中心

国家环境保护有机化工废水处理与资源化工程技术中心

国家环境保护长江中下游水生态健康重点实验室

江苏省固体废物资源化工程研究中心

江苏省生态环境保护化学品安全与健康风险研究重点实验室

南京大学-江苏省环境保护厅环境管理与政策研究中心

江苏省大气污染控制联合实验室（与江苏省环科院、南京信息工程大学合建）